| Division 1 - Division 1 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| METZ - Bordeaux | 1-0 |
| MARSEILLE - Auxerre | 2-0 |
| Division 1 - Division 2 |
| Vendredi 22 janvier 1999 |
| Niort (D2) - STRASBOURG (D1) | 0-0 (2-3 tab) |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| AMIENS (D2) - Monaco (D1) | 1-1 (5-4 tab) |
| SOCHAUX (D1) - Beauvais (D2) | 3-1 |
| LAVAL (D2) - Nancy (D1) | 1-0 |
| TROYES (D2) - Montpellier (D1) | 2-1 |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| CHÂTEAUROUX (D2) - Lyon (D1) | 1-0 |
| Division 1 - National |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| PARIS FC (N) - Lorient (D1) | 1-0 |
| Mardi 9 février 1999 |
| Thouars (N) - PARIS SG (D1) | 1-2 ap |
| Division 1 - CFA |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| La Roche-sur-Yon (CFA) - NANTES (D1) | 0-1 |
| Armentière (CFA) - LENS (D1) | 2-5 ap |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| DIJON (CFA) - Bastia (D1) | 2-1 |
| Division 1 - CFA 2 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| Coulaines (CFA 2) - RENNES (D1) | 0-4 |
| Blaganc (CFA 2) - LE HAVRE (D1) | 0-2 ap |
| JURA SUD (CFA 2) - Toulouse (D1) | 1-1 (8-7 tab) |
| Division 2 - Division 2 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| GUINGAMP - Red Star | 1-0 |
| Division 2 - National |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| Istres (N) - NÎMES (D2) | 1-3 |
| AJACCIO GFCO (N) - Nice (D2) | 1-1 (4-2 tab) |
| Valenciennes (N) - WASQUEHAL (D2) | 2-3 |
| LE MANS (D2) - Louhans-Cx (N) | 4-1 |
| Division 2 - CFA 2 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| Chaumont (CFA 2) - SEDAN (D2) | 0-3 |
| Division 2 - DH |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| Dives (DH) - LILLE (D2) | 0-2 |
| National - CFA |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| ST-DENIS ST-LEU (CFA) - Angers (N) | 1-0 |
| National - CFA 2 |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| SAINT-GEORGES (CFA 2) - Martigues (N) | 1-1 (5-4 tab) |
| National - DH |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| Mende (DH) - ANGOULÊME (N) | 1-4 |
| CFA - CFA |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| Rodez - CLERMONT FOOT | 0-1 |
| CFA - CFA 2 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| CHÂTELLERAULT (CFA) - Fontenay (CFA 2) | 2-2 (6-5 tab) |
| CFA - DH |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| Vauban Strasbourg (DH) - BOULOGNE (CFA) | 1-2 |
| Chasselay (DH) - GRENOBLE (CFA) | 0-3 |
| CFA 2 - CFA 2 |
| Samedi 23 janvier 1999 |
| ROUEN - Sarrebourg | 1-0 ap |
| Dimanche 24 janvier 1999 |
| Mondeville - LA MONTAGNARDE | 0-0 (1-3 tab) |
| Division 1 - Division 1 |
| Samedi 20 février 1999 |
| LENS - Marseille | 3-1 |
| Paris SG - NANTES | 1-1 (4-5 tab) |
| Division 1 - Division 2 |
| Vendredi 19 février 1999 |
| LE MANS (D2) - Rennes (D1) | 2-0 |
| Wasquehal (D2) - METZ (D1) | 0-2 |
| Samedi 20 février 1999 |
| AMIENS (D2) - Le Havre (D1) | 1-0 |
| GUINGAMP (D2) - Strasbourg (D1) | 2-1 ap |
| Division 1 - CFA 2 |
| Vendredi 19 février 1999 |
| SAINT-GEORGES (CFA 2) - Sochaux (D1) | 1-0 |
| Division 2 - Division 2 |
| Samedi 20 février 1999 |
| Châteauroux - LAVAL | 1-2 |
| Division 2 - National |
| Vendredi 19 février 1999 |
| Ajaccio GFCO (N) - TROYES (D2) | 1-1 (1-3 tab) |
| Division 2 - CFA |
| Samedi 20 février 1999 |
| Dijon (CFA) - SEDAN (D2) | 0-4 |
| Dimanche 21 février 1999 |
| Boulogne (CFA) - LILLE (D2) | 1-2 |
| Samedi 27 février 1999 |
| Grenoble (CFA) - NÎMES (D2) | 2-3 ap |
| National - CFA |
| Samedi 20 février 1999 |
| ANGOULÊME (N) - Châtellerault (CFA) | 1-0 |
| National - CFA 2 |
| Samedi 20 février 1999 |
| LA MONTAGNARDE (CFA 2) - Paris FC (N) | 4-0 |
| CFA - CFA 2 |
| Samedi 20 février 1999 |
| ROUEN (CFA 2) - St-Denis-St-Leu (CFA) | 2-0 |
| CLERMONT FOOT (CFA) - Jura Sud (CFA 2) | 4-1 |
