6e édition de la Coupe de la Ligue
Premier tour
| Division 2 - Division 2 | |
| Mardi 16 novembre 1999 | |
| Lorient - CRÉTEIL | 1-1 (1-4 tab) |
| SOCHAUX - Ajaccio AC | 3-0 |
| NICE - Cannes | 1-0 |
| NIORT - Laval | 3-2 ap |
| Caen - LE MANS | 1-2 |
| Mercredi 24 novembre 1999 | |
| Wasquehal - CHÂTEAUROUX | 4-4 (4-5 tab) |
| Division 2 - National | |
| Mardi 16 novembre 1999 | |
| Lille (D2) - RED STAR (N) | 2-2 (1-4 tab) |
| BEAUVAIS (N) - Valence (D2) | 2-2 (5-4 tab) |
| TOULOUSE (D2) - Martigues (N) | 1-0 |
Seizièmes de finale
| Division 1 - Division 1 | |
| Vendredi 7 janvier 2000 | |
| Auxerre - MONACO | 0-0 (4-5 tab) |
| Samedi 8 janvier 2000 | |
| STRASBOURG - Metz | 0-0 (2-0 tab) |
| Troyes - BORDEAUX | 0-1 ap |
| Dimanche 9 janvier 2000 | |
| BASTIA - Marseille | 3-0 |
| ST-ETIENNE - Nantes | 3-1 |
| Division 1 - Division 2 | |
| Samedi 8 janvier 2000 | |
| TOULOUSE (D2) - Lens (D1) | 3-2 ap |
| LYON (D1) - Amiens (D2) | 3-1 |
| PARIS SG (D1) - Créteil (D2) | 4-3 |
| Louhans-Cx (D2) - NANCY (D1) | 0-1 |
| SOCHAUX (D2) - Rennes (D1) | 2-0 |
| Dimanche 9 janvier 2000 | |
| Nice (D2) - SEDAN (D1) | 0-1 |
| Guingamp (D2) - MONTPELLIER (D1) | 1-3 |
| Division 1 - National | |
| Vendredi 7 janvier 2000 | |
| BEAUVAIS (N) - Le Havre (D1) | 1-1 (5-4 tab) |
| Division 2 - Division 2 | |
| Samedi 8 janvier 2000 | |
| Le Mans - CHÂTEAUROUX | 1-1 (5-6 tab) |
| Niort - GUEUGNON | 0-1 |
| Division 2 - National | |
| Samedi 8 janvier 2000 | |
| RED STAR (N) - Nîmes (D2) | 4-2 ap |
Huitièmes de finale
| Division 1 - Division 1 | |
| Samedi 29 janvier 2000 | |
| Monaco - STRASBOURG | 2-3 ap |
| LYON - Bordeaux | 1-0 |
| Dimanche 30 janvier 2000 | |
| BASTIA - Montpellier | 1-0 |
| Division 1 - Division 2 | |
| Samedi 29 janvier 2000 | |
| Châteauroux (D2) - PARIS SG (D1) | 0-1 |
| Jeudi 10 février 2000 | |
| NANCY (D1) - Sochaux (D2) | 2-1 ap |
| Division 1 - National | |
| Samedi 29 janvier 2000 | |
| St-Etienne (D1) - RED STAR (N) | 1-3 |
| Beauvais (N) - SEDAN (D1) | 0-1 ap |
| Division 2 - Division 2 | |
| Samedi 29 janvier 2000 | |
| GUEUGNON - Toulouse | 1-0 |
Quarts de finale
| Division 1 - Division 1 | |
| Samedi 19 février 2000 | |
| Lyon - BASTIA | 0-1 ap |
| Dimanche 20 février 2000 | |
| PARIS SG - Nancy | 3-0 |
| Division 1 - Division 2 | |
| Samedi 19 février 2000 | |
| GUEUGNON (D2) - Strasbourg (D1) | 2-0 |
| Division 1 - National | |
| Dimanche 20 février 2000 | |
| Sedan (D1) - RED STAR (N) | 0-1 |
Demi-finales
| Division 1 - Division 1 | |
| Samedi 1er avril 2000 | |
| PARIS SG - Bastia | 4-2 |
| Division 2 - National | |
| Lundi 3 avril 2000 | |
| Red Star (N) - GUEUGNON (D2) | 2-2 (8-9 tab) |
Finale
| Division 1 - Division 2 | |
| Samedi 22 avril 2000 | |
| GUEUGNON (D2) - Paris SG (D1) | 2-0 |
